Am Standort Nollendorfplatz in Bezirk Schöneberg-Tempelhof, am Rande der West-City befindet sich seit 1971 das so genannte Haupthaus, das Jugendhaus City.
Im Märkischen Viertel im Bezirk Reinickendorf betreibt der CVJM Berlin in einem Holzhaus, der „Baracke“ seit 1970 seine Jugendarbeit.
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Jüngstes Kind im CVJM Berlin ist seit 1992 die Filiale im Bezirk Marzahn-Hellersdorf. Dicht am Ortskern von Alt Marzahn betreibt der CVJM Berlin seit 2002 sein Jugendhaus Trinity.
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